RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 MFSD14AQ96MC6 490 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACAP3Q96P50 834 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCIF1Q9H4Z3 704 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZMAT4Q9H898 229 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 DGKIO75912 1065 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 ESR1P03372 595 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 COL6A2P12110 1019 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD40P25942 277 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 EGR3Q06889 387 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 PDCD1Q15116 288 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM181AQ8N9Y4 354 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 RUNDC1Q96C34 613 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 TEKT5Q96M29 485 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 BTG4Q9NY30 223 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP25Q9UHP3 1055 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 DSEQ9UL01 958 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 INVSQ9Y283 1065 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 C22orf46C9J442 243 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 WIPF1O43516 503 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 KDM1AO60341 852 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 FPR2P25090 351 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 CORO7P57737 925 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 PICALMQ13492 652 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRM3Q14832 879 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 C4orf46Q504U0 113 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 MROH9Q5TGP6 573 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 MTA3Q9BTC8 594 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 SP110Q9HB58 689 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNH7Q9NS40 1196 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATG3Q9NT62 314 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 MARCH2Q9P0N8 246 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 GULP1Q9UBP9 304 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A1W2PQY0 241 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRIT1O00522 736 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCDO00767 359 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNK3O14649 394 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 FNTBP49356 437 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 MOGSQ13724 837 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACAP2Q15057 778 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 EPHA7Q15375 998 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLUL1Q15846 466 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 IL31Q6EBC2 164 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYP4F22Q6NT55 531 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRR23CQ6ZRP0 262 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLCO6A1Q86UG4 719 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 NETO1Q8TDF5 533 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 JADE3Q92613 823 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 C16orf92Q96LL3 132 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRGUKQ96M69 825 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-272P-201ENST00000411028 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms