RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PMS1-205ENST00000409985 CCDC155Q8N6L0 562 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-205ENST00000409985 EXOC4Q96A65 974 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-205ENST00000409985 MMS19Q96T76 1030 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-205ENST00000409985 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PMS1-205ENST00000409985 ENC1O14682 589 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-205ENST00000409985 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PMS1-205ENST00000409985 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PMS1-205ENST00000409985 SNX12Q9UMY4 172 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-205ENST00000409985 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ATP2B2Q01814 1243 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 TRIM59Q8IWR1 403 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ERMNQ8TAM6 284 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 FAM20AQ96MK3 541 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 AMNQ9BXJ7 453 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 DEF6Q9H4E7 631 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 HDAC6Q9UBN7 1215 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 LRRC53A6NM62 1247 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 TRAF5O00463 557 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 MEIS2O14770 477 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 EPHB6O15197 1021 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 AKR1B10O60218 316 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 CYP11B2P19099 503 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 CYP27A1Q02318 531 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 CASP8Q14790 479 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 RRAGAQ7L523 313 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ALS2CR12Q96Q35 445 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 TFRCP02786 760 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 TCP1P17987 556 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 KCNMA1Q12791 1236 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 TRAF1Q13077 416 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 MICALL2Q8IY33 904 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 KCTD10Q9H3F6 313 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 MED4Q9NPJ6 270 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 GLTPD2A6NH11 291 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 CIITAP33076 1130 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 EPS15P42566 896 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 LRRC41Q15345 812 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 CCDC40Q4G0X9 1142 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 CCDC70Q6NSX1 233 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 MMGT1Q8N4V1 131 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ETNPPLQ8TBG4 499 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 TSKSQ9UJT2 592 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 USP17L15C9J2P7 530 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 USP17L11C9JVI0 530 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 USP17L18D6R9N7 530 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 USP17L22D6RA61 530 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 USP17L19D6RCP7 530 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 USP17L20D6RJB6 530 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 SERPING1P05155 500 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 SLC12A3P55017 1021 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP4P98171 946 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 USP17L24Q0WX57 530 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 GPBP1Q86WP2 473 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 TFR2Q9UP52 801 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 E9PMD0 336 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 RPA1P27694 616 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 SREBF1P36956 1147 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 MAGEA1P43355 309 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 DUSP10Q9Y6W6 482 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 POTECB2RU33 542 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ENTPD3O75355 529 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 HGSNATQ68CP4 663 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 GLIS3Q8NEA6 775 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 SCFD1Q8WVM8 642 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 RNF14Q9UBS8 474 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 MACROD2A1Z1Q3 448 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 H3BQF6 201 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 ICA1Q05084 483 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 KRT26Q7Z3Y9 468 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-205ENST00000409985 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
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