RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 KCNA2P16389 499 aa22.69■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 NEK9Q8TD19 979 aa22.69■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 SMTNL1A8MU46 457 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 PGK2P07205 417 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 ICAM3P32942 547 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 DDX12PQ92771 950 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 MCM3APO60318 1980 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 MYL5Q02045 173 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 WDR78Q5VTH9 848 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 UNC13DQ70J99 1090 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 NFASCO94856 1347 aa22.67■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 KRT76Q01546 638 aa22.67■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 DYMQ7RTS9 669 aa22.67■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 TPH2Q8IWU9 490 aa22.67■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 MED15Q96RN5 788 aa22.67■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 GDAQ9Y2T3 454 aa22.67■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.67■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 EYA4O95677 639 aa22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 CCNE2O96020 404 aa22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 CYP11B2P19099 503 aa22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 LXNQ9BS40 222 aa22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 B4DLN1 442 aa22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 EHHADHQ08426 723 aa22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 PDE4DQ08499 809 aa22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 EXOC1Q9NV70 894 aa22.66■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.65■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 WDR64B1ANS9 1081 aa22.65■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 SFNP31947 248 aa22.65■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 JAK3P52333 1124 aa22.65■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 ARSHQ5FYA8 562 aa22.65■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 GPBP1Q86WP2 473 aa22.65■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.65■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 RDM1Q8NG50 284 aa22.65■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 ADCY5O95622 1261 aa22.64■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 INHBEP58166 350 aa22.64■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 SARM1Q6SZW1 724 aa22.64■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 BANK1Q8NDB2 785 aa22.64■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 MORC4Q8TE76 937 aa22.64■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC102AQ96A19 550 aa22.64■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.64■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 NACC1Q96RE7 527 aa22.64■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.64■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 STRNO43815 780 aa22.64■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 PRCPP42785 496 aa22.64■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 PLCB2Q00722 1185 aa22.64■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 SP2Q02086 613 aa22.64■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.64■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.64■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.64■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 SAMM50Q9Y512 469 aa22.64■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.63■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 STK4Q13043 487 aa22.63■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.63■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.63■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 IFNL1Q8IU54 200 aa22.63■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 ADSSL1Q8N142 457 aa22.63■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.63■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.62■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 TOMM70O94826 608 aa22.62■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 LYPLA2O95372 231 aa22.62■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 ADORA2AP29274 412 aa22.62■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.62■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB39O15060 712 aa22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms