RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF6Q15052 776 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 USH1CQ9Y6N9 552 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8CPA6NN73 597 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 K7ERI5 159 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 MCF2LO15068 1137 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CYP27A1Q02318 531 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 UNC13DQ70J99 1090 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 MIPOL1Q8TD10 442 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 MXD3Q9BW11 206 aa21.94■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 SAT1P21673 171 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 METTL23Q86XA0 190 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB5O15062 677 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 DDIT3P35638 169 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ARL4AP40617 200 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 MB21D1Q8N884 522 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 KIF1BO60333 1816 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF233A6NK53 670 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 MOCS3O95396 460 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 MYO1EQ12965 1108 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 PODNQ7Z5L7 613 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.93■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 GPC4O75487 556 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 IFNAR2P48551 515 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 C7orf31Q8N865 590 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 KRT1P04264 644 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CXCR5P32302 372 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ALX1Q15699 326 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CD209Q9NNX6 404 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ANAPC5Q9UJX4 755 aa21.92■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYND10O75800 440 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ECE1P42892 770 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 SARM1Q6SZW1 724 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 SNAP23O00161 211 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 MFAP3LO75121 409 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CCNYQ8ND76 341 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 VCX3AQ9NNX9 186 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 GDAQ9Y2T3 454 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2D6P10635 497 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ASPHQ12797 758 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 SLMAPQ14BN4 828 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM42Q8IWZ5 723 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP61Q8NHU2 1237 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP7Q8WX94 980 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CALN1Q9BXU9 219 aa21.91■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ADRA2BP18089 450 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 RFX1P22670 979 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 SNX1Q13596 522 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CRKP46108 304 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 MUM1Q2TAK8 710 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.9■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 LRRD1A4D1F6 860 aa21.89■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ACTN1P12814 892 aa21.89■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 JAK3P52333 1124 aa21.89■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 DBN1Q16643 649 aa21.89■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ABCC3O15438 1527 aa21.89■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.89■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 NEDD4P46934 1319 aa21.89■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CPP00450 1065 aa21.89■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms