RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF25-201ENST00000348333 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF25-201ENST00000348333 CNKSR3Q6P9H4 555 aa26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF25-201ENST00000348333 LMBR1Q8WVP7 490 aa26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF25-201ENST00000348333 REV3LO60673 3130 aa26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARP10275 920 aa26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADAM17P78536 824 aa26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 PKN1Q16512 942 aa26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 PHKBQ93100 1093 aa26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDHR1Q96JP9 859 aa26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 CERS4Q9HA82 394 aa26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 CTSHP09668 335 aa26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 SCG2P13521 617 aa26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 MARK3P27448 753 aa26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPM1EQ8WY54 764 aa26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRDM6Q9NQX0 595 aa26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNH7Q9NS40 1196 aa26■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 WDR81Q562E7 1941 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 EPOPA6NHQ4 379 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 RFXAPO00287 272 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 RSPH10BP0C881 870 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNJ6P48051 423 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARHGAP4P98171 946 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 NTRK3Q16288 839 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 FBXL16Q8N461 479 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCYT2Q99447 389 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRANK1O15050 2925 aa25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 LCHNA4D1U4 455 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 PARNO95453 639 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 SREBF1P36956 1147 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 RUFY4Q6ZNE9 571 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 LGR5O75473 907 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGFBP4P22692 258 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 TAP1Q03518 808 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 UIMC1Q96RL1 719 aa25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSMA5P28066 241 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 AP3B2Q13367 1082 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 CEP55Q53EZ4 464 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 RUFY3Q7L099 469 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM86B1E9PN63 330 aa25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 TLL1O43897 1013 aa25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 GLG1Q92896 1179 aa25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 EMSYQ7Z589 1322 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 NRCAMQ92823 1304 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 ESYT2A0FGR8 921 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 MEIS1O00470 390 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAFGO15525 162 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 GNAT1P11488 350 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 EVCP57679 992 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPFIA1Q13136 1202 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 IKBKEQ14164 716 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 GRIK4Q16099 956 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 CUL9Q8IWT3 2517 aa25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 NFASCO94856 1347 aa25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACTR2P61160 394 aa25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms