RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323701.10

USP39-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP39, Length 2,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-201ENST00000323701 PCNTO95613 3336 aa20.54■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 SLC26A4O43511 780 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 HERVK_113P62684 666 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 CNTN2Q02246 1040 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 SEMA3FQ13275 785 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 TEX33O43247 280 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 BANK1Q8NDB2 785 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 PANK4Q9NVE7 773 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.53■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.52■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 PSMA7O14818 248 aa20.52■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.52■□□□□ 0.88
USP39-201ENST00000323701 A0A1B0GTH6 734 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 RSPH10BP0C881 870 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 GIT2Q14161 759 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 NR1I3Q14994 352 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 Q3C1V9 767 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 VSTM4Q8IW00 320 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 P2RX5Q93086 422 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 REEP2Q9BRK0 252 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 CCNE2O96020 404 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 KRT31Q15323 416 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 EPHA7Q15375 998 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 LXNQ9BS40 222 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 EYA4O95677 639 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 CCNE1P24864 410 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 CCND2P30279 289 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 STIM1Q13586 685 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 CBFA2T2O43439 604 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 MB21D1Q8N884 522 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 CHST13Q8NET6 341 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 TRIM47Q96LD4 638 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 KCNJ18B7U540 433 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 KCNJ12Q14500 433 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 CENPPQ6IPU0 288 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 STK24Q9Y6E0 443 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 CYP2C8P10632 490 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 CASP5P51878 434 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 UGCGQ16739 394 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 SFI1A8K8P3 1242 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 TPM3P06753 285 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 ERCC3P19447 782 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 VPS16Q9H269 839 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 TMEM150BA6NC51 233 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 SORBS3O60504 671 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 PSMD2Q13200 908 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-201ENST00000323701 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms