RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 SULF1Q8IWU6 871 aa23.87■■□□□ 1.41
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.87■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR90Q96KV7 1748 aa23.87■■□□□ 1.41
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SNRNP25-201ENST00000293861 ARP10275 920 aa23.86■■□□□ 1.41
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SNRNP25-201ENST00000293861 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.86■■□□□ 1.41
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SNRNP25-201ENST00000293861 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.85■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 RGL1Q9NZL6 768 aa23.85■■□□□ 1.41
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SNRNP25-201ENST00000293861 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 EPHA7Q15375 998 aa23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 REEP2Q9BRK0 252 aa23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 CAPN11Q9UMQ6 739 aa23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
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SNRNP25-201ENST00000293861 NEK9Q8TD19 979 aa23.84■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.84■■□□□ 1.41
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SNRNP25-201ENST00000293861 RNF146Q9NTX7 359 aa23.83■■□□□ 1.41
SNRNP25-201ENST00000293861 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.83■■□□□ 1.4
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SNRNP25-201ENST00000293861 SOWAHDA6NJG2 315 aa23.82■■□□□ 1.4
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SNRNP25-201ENST00000293861 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.82■■□□□ 1.4
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SNRNP25-201ENST00000293861 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25-201ENST00000293861 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.82■■□□□ 1.4
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SNRNP25-201ENST00000293861 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25-201ENST00000293861 DNAJC7Q99615 494 aa23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25-201ENST00000293861 JADE2Q9NQC1 790 aa23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25-201ENST00000293861 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SNRNP25-201ENST00000293861 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
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