RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SP2Q02086 613 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PNOCQ13519 176 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POSTNQ15063 836 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 E2F4Q16254 413 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPRASP2Q96D09 838 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDIA5Q14554 519 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LY6KQ17RY6 165 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HAS1Q92839 578 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PP2D1A8MPX8 630 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADCY6O43306 1168 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INHAP05111 366 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYBAP13498 195 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UVSSAQ2YD98 709 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COPS5Q92905 334 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DISC1Q9NRI5 854 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBX3O15119 743 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MARCH6O60337 910 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDC25AP30304 524 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ICAM3P32942 547 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CABP7Q86V35 215 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCFD2Q8WU76 684 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNGA1P29973 690 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNA2P16389 499 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMPD1P17405 629 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STAT6P42226 847 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NLRP12P59046 1061 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTLL4Q14679 1199 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PAGE5Q96GU1 130 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC5A5Q92911 643 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDHR1Q96JP9 859 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAFGO15525 162 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRR29P0C7W0 189 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM20AQ96MK3 541 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CUEDC2Q9H467 287 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMC2O95347 1197 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GGPS1O95749 300 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF165P49910 485 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SP4Q02446 784 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNFAIP2Q03169 654 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMARCE1Q969G3 411 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CALML4Q96GE6 196 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CBX8Q9HC52 389 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POTEMA6NI47 508 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BIN1O00499 593 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TGFB3P10600 412 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AFMP43652 599 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms