RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SMTNP53814 917 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 USH1GQ495M9 461 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 NACC1Q96RE7 527 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 KLRC4O43908 158 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 ZMYND10O75800 440 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 RFX1P22670 979 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 CALCOCO2Q13137 446 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 SLC18A3Q16572 532 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 TPH2Q8IWU9 490 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 OGFOD1Q8N543 542 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 GUCY2FP51841 1108 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 IL17AQ16552 155 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 BMP3P12645 472 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 AKR1B1P15121 316 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A2P36021 539 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 KCNH2Q12809 1159 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 CPVLQ9H3G5 476 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 MYH3P11055 1940 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 UBE4BO95155 1302 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 NDC80O14777 642 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB22O15209 634 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 SASH3O75995 380 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 NAB2Q15742 525 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 NYAP2Q9P242 653 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 USP17L10C9JJH3 530 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 E9PMD0 336 aa9.66□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 PJA2O43164 708 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 FTCDO95954 541 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 SCNN1DP51172 638 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 GYS2P54840 703 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 MYL7Q01449 175 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 TMEM206Q9H813 350 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 GCNT4Q9P109 453 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 CHMP2AO43633 222 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 ERCC3P19447 782 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 KCNQ4P56696 695 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 FAM81BQ96LP2 452 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 H0YIN7 160 aa9.65□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.65□□□□□ -0.86
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HERC3-201ENST00000264345 PARVGQ9HBI0 331 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 INTUQ9ULD6 942 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 KIF4AO95239 1232 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NR3C1P04150 777 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CXCR5P32302 372 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 BIRC3Q13489 604 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NEK9Q8TD19 979 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 EFCC1Q9HA90 598 aa9.65□□□□□ -0.87
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