RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 VSTM4Q8IW00 320 aa25.25■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.25■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 A0A1B0GTH6 734 aa25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 GJA5P36382 358 aa25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 LRMPQ12912 555 aa25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 ARID5BQ14865 1188 aa25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 HERVK_113P62684 666 aa25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 NR1I3Q14994 352 aa25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 TRIM47Q96LD4 638 aa25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.24■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 BICDL2A1A5D9 508 aa25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 GSDMDP57764 484 aa25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 CLCN1P35523 988 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 SPAG1Q07617 926 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 GIT2Q14161 759 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 FBXO40Q9UH90 709 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 UNCXA6NJT0 531 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 ATP9AO75110 1047 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 CNMDO75829 334 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 PTPN21Q16825 1174 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 CENPPQ6IPU0 288 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 NEK9Q8TD19 979 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 GPRASP2Q96D09 838 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 THAP9Q9H5L6 903 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 RRAGCQ9HB90 399 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 PYCARDQ9ULZ3 195 aa25.22■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 LCTP09848 1927 aa25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 KCNJ18B7U540 433 aa25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 KCNJ12Q14500 433 aa25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 KRT31Q15323 416 aa25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 NACC1Q96RE7 527 aa25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 LXNQ9BS40 222 aa25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.21■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 SNAPC2Q13487 334 aa25.2■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 NLRX1Q86UT6 975 aa25.2■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 BANK1Q8NDB2 785 aa25.2■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 REEP2Q9BRK0 252 aa25.2■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.2■■□□□ 1.63
RNF170-201ENST00000240159 PFASO15067 1338 aa25.2■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 ZBTB39O15060 712 aa25.2■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 LRRC41Q15345 812 aa25.2■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.2■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 RGS20O76081 388 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 OSBPP22059 807 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 MAFGO15525 162 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 DNERQ8NFT8 737 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 TEX33O43247 280 aa25.18■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 STAM2O75886 525 aa25.18■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 CNTN2Q02246 1040 aa25.18■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.18■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.18■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 IWS1Q96ST2 819 aa25.18■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.18■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.18■■□□□ 1.62
RNF170-201ENST00000240159 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.18■■□□□ 1.62
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