RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF569Q5MCW4 686 aa11.72□□□□□ -0.53
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PRRX1-201ENST00000239461 C4orf32Q8N8J7 132 aa11.72□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 SPATA20Q8TB22 786 aa11.72□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 ALS2CR12Q96Q35 445 aa11.72□□□□□ -0.53
PRRX1-201ENST00000239461 CNTNAP1P78357 1384 aa11.71□□□□□ -0.53
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PRRX1-201ENST00000239461 CELF2O95319 508 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
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PRRX1-201ENST00000239461 TUBB4BP68371 445 aa11.7□□□□□ -0.54
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PRRX1-201ENST00000239461 FAM184BQ9ULE4 1060 aa11.69□□□□□ -0.54
PRRX1-201ENST00000239461 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRRX1-201ENST00000239461 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRRX1-201ENST00000239461 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRRX1-201ENST00000239461 STAT3P40763 770 aa11.69□□□□□ -0.54
PRRX1-201ENST00000239461 CEP55Q53EZ4 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PRRX1-201ENST00000239461 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.69□□□□□ -0.54
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