RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.3■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 ACTR2P61160 394 aa25.29■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 LETM2Q2VYF4 491 aa25.29■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 NEK8Q86SG6 692 aa25.29■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.29■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 GJA10Q969M2 543 aa25.29■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.29■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 WNT7AO00755 349 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 SLC37A4O43826 429 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 LGR5O75473 907 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 CHMP4BP1P59074 171 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 SLC5A5Q92911 643 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.27■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 GJB2P29033 226 aa25.27■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 HOXC8P31273 242 aa25.27■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.27■■□□□ 1.64
SYF2-201ENST00000236273 PSMD10O75832 226 aa25.26■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.26■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.26■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 BADQ92934 168 aa25.26■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.26■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 EMSYQ7Z589 1322 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 KIF28PB7ZC32 967 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 TIMP1P01033 207 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 CYP2C9P11712 490 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 C7orf31Q8N865 590 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 RIT2Q99578 217 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.24■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.24■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 BMP8BP34820 402 aa25.24■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 HAS1Q92839 578 aa25.24■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 SNX21Q969T3 373 aa25.24■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.23■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 RAG1P15918 1043 aa25.23■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 ADAM17P78536 824 aa25.23■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 PTGISQ16647 500 aa25.23■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.23■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.22■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.22■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 WDR81Q562E7 1941 aa25.22■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 ATP4AP20648 1035 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 CYP2C18P33260 490 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 STAT5BP51692 787 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 KRT76Q01546 638 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 GLG1Q92896 1179 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 WNT8BQ93098 351 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 VWCEQ96DN2 955 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 HIPK3Q9H422 1215 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 SETD4Q9NVD3 440 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SYF2-201ENST00000236273 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 MARK3P27448 753 aa25.2■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 EPHB4P54760 987 aa25.2■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.2■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 MFSD5Q6N075 450 aa25.2■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 POTEDQ86YR6 584 aa25.2■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 GAS7O60861 476 aa25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 PLCB4Q15147 1175 aa25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 NOSTRINQ8IVI9 506 aa25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SYF2-201ENST00000236273 FAM20AQ96MK3 541 aa25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.7 ms