RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068056.11

Ddx39b-201, Transcript of Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddx39b, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cdca8Q8BHX3 289 aa20.51■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tmod3Q9JHJ0 352 aa20.51■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fmnl1Q9JL26 1094 aa20.51■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 A0A0U1RNP2 1173 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm4788E9Q8B5 879 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Atp6v1dP57746 247 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cplx1P63040 134 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rsbn1lD3Z0K6 821 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Bbs9Q811G0 885 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dmtf1Q8CE22 761 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cep57l1Q8VDS7 400 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trpv6Q91WD2 767 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Spred2Q924S7 410 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Wnt8bQ9WUD6 350 aa20.5■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Robo3Q9Z2I4 1366 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tmem131O70472 1877 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm12800B1AUV4 484 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm12794L7MTS5 483 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gp6P0C191 313 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 IqceQ6PCQ0 778 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Grik4Q8BMF5 956 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 N4bp3Q8C7U1 537 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Plcb4Q91UZ1 1175 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tmem192Q9CXT7 266 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Wdr64Q9D565 1086 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 NapaQ9DB05 295 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vav3Q9R0C8 847 aa20.49■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MafgO54790 162 aa20.48■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gpatch11Q3UFS4 262 aa20.48■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Icam5Q60625 917 aa20.48■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mcf2lQ64096 1149 aa20.48■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ifit1Q64282 463 aa20.48■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 C6.1alQ7M757 291 aa20.48■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fbxo44Q8BK26 255 aa20.48■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zmynd15Q8C0R7 736 aa20.48■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hoxc8P09025 242 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Wnt7aP24383 349 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Xkr5Q5GH66 676 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sestd1Q80UK0 696 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sun2Q8BJS4 731 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Larp6Q8BN59 492 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trim47Q8C0E3 641 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 VcpkmtQ8C436 228 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 ClmnQ8C5W0 1052 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr397Q8VEZ6 315 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ppp2r5dQ91V89 594 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc25a38Q91XD8 326 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Map7d1A2AJI0 846 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 2610008E11RikG3X964 669 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Esr2O08537 530 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 P01644 108 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 P01645 108 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 P01646 108 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 P01647 108 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MylipQ8BM54 445 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nrbp2Q91V36 499 aa20.47■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa20.46■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1110002E22RikE0CYV9 1786 aa20.46■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PcntP48725 2898 aa20.46■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa20.46■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Bag4Q8CI61 457 aa20.46■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Syt17Q920M7 470 aa20.46■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ranbp17Q99NF8 1088 aa20.46■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MutyhQ99P21 515 aa20.46■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Map2k5Q9WVS7 448 aa20.46■□□□□ 0.87
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mroh8E9PYI4 1049 aa20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc39a2G3X943 309 aa20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Api5O35841 504 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MafbP54841 323 aa20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 DmwdQ08274 665 aa20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Syce2Q505B8 171 aa20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dph1Q5NCQ5 438 aa20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm11487Q5RIS0 354 aa20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 GlyctkQ8QZY2 523 aa20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Akirin1Q99LF1 191 aa20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 IydQ9DCX8 285 aa20.45■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm5737A0A140LI11 423 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tmem240B2RWJ3 173 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm3095E9Q058 166 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Q5XFZ0 217 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Prmt7Q922X9 692 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mcoln1Q99J21 580 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Eif2ak1Q9Z2R9 619 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zfp213E9QAW0 468 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 UgcgO88693 394 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ptpn22P29352 802 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hoxc13P50207 328 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 CgnP59242 1191 aa20.44■□□□□ 0.86
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trak2Q6P9N8 913 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.1 ms