RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637630.1

NRIP1-205, Transcript of nuclear receptor interacting protein 1, human

TSL 3

Gene NRIP1, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRIP1-205	ENST00000637630	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630		H3BRB1	525 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	F2	P00734	622 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	CYP3A4	P08684	503 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	ITGB5	P18084	799 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	SCRN1	Q12765	414 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	USP11	P51784	963 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	SP4	Q02446	784 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	TRIM29	Q14134	588 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	GPR20	Q99678	358 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	NFASC	O94856	1347 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	CEP290	O15078	2479 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	MEIS1	O00470	390 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	LGALS2	P05162	132 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	PFKM	P08237	780 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	KCNA2	P16389	499 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	CYP2C18	P33260	490 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	RFC2	P35250	354 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	KAT2B	Q92831	832 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	GLG1	Q92896	1179 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	HAS3	O00219	553 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	ST18	O60284	1047 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	ATP9A	O75110	1047 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	CYP2C9	P11712	490 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	CSF2RA	P15509	400 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	ITGB8	P26012	769 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	SHH	Q15465	462 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	ME3	Q16798	604 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NRIP1-205	ENST00000637630	FGB	P02675	491 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	ACTN1	P12814	892 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	CCL23	P55773	120 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	PTK7	Q13308	1070 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19	1e-11	■■■■■ 39.4
NRIP1-205	ENST00000637630	RABEP1	Q15276	862 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NRIP1-205	ENST00000637630	AR	P10275	920 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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