RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627393.1

PCNP-208, Transcript of PEST proteolytic signal containing nuclear protein, human

TSL 2 BASIC

Gene PCNP, Length 136 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNP-208	ENST00000627393	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	KCNK12	Q9HB15	430 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	FBXO3	Q9UK99	471 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	LAMA1	P25391	3075 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	LRRN2	O75325	713 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	EOMES	O95936	686 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PRB1	P04280	392 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	GLUL	P15104	373 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CYP7A1	P22680	504 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	APBB2	Q92870	758 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	COPS5	Q92905	334 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	WNT8B	Q93098	351 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	GPR20	Q99678	358 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SNRK	Q9NRH2	765 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	LCT	P09848	1927 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.03	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	APAF1	O14727	1248 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	TM4SF5	O14894	197 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	DGKI	O75912	1065 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	CTSH	P09668	335 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	ALAS1	P13196	640 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	AKR1B1	P15121	316 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	PSEN2	P49810	448 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	LIMK1	P53667	647 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	OAZ1	P54368	228 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	ERVFC1	P60507	584 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	UBE3A	Q05086	875 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	GABPA	Q06546	454 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	PDE4D	Q08499	809 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	KCNC3	Q14003	757 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	MFSD10	Q14728	455 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	CCDC6	Q16204	474 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	SHD	Q96IW2	340 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PCNP-208	ENST00000627393	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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