RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621293.4

TSPAN10-205, Transcript of tetraspanin 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPAN10, Length 1,868 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN10-205ENST00000621293 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 NUP58Q9BVL2 599 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 PSMD10O75832 226 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 KRT9P35527 623 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 PNMA2Q9UL42 364 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 MTF1Q14872 753 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 SYCP1Q15431 976 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 ARSHQ5FYA8 562 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 IQCDQ96DY2 449 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 CAPN11Q9UMQ6 739 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 USP14P54578 494 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 ADGRG1Q9Y653 693 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 RPTORQ8N122 1335 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 TTC26A0AVF1 554 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 MUTP22033 750 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 LRRC41Q15345 812 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 DNAJC7Q99615 494 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 DESI2Q9BSY9 194 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 L2HGDHQ9H9P8 463 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 PARP14Q460N5 1801 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 EML1O00423 815 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 MEIS1O00470 390 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 PSMC6P62333 389 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 MAN2A1Q16706 1144 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 FIGNQ5HY92 759 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 EYA4O95677 639 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 VCAM1P19320 739 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 GIT2Q14161 759 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 DNAI1Q9UI46 699 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 FDX1P10109 184 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 ERVK-24P63145 666 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 CYP4A11Q02928 519 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 MTMR2Q13614 643 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 VWA3BQ502W6 1294 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 CEP63Q96MT8 703 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 GAS7O60861 476 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 UBXN2AP68543 259 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPAN10-205ENST00000621293 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 FLOT1O75955 427 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 BCRP11274 1271 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 REEP2Q9BRK0 252 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 NDST4Q9H3R1 872 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 A0A1W2PQJ5 194 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 NFIBO00712 420 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 TSC1Q92574 1164 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 RIT2Q99578 217 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPAN10-205ENST00000621293 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms