RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593072.5

EFTUD2-225, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 5

Gene EFTUD2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-225ENST00000593072 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 FAM227BQ96M60 508 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 TTC14Q96N46 770 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 KAT14Q9H8E8 782 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 CD207Q9UJ71 328 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 MCM3APO60318 1980 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 GBF1Q92538 1859 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 GFRA3O60609 400 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 PPFIA3O75145 1194 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 TBX10O75333 385 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 RGS20O76081 388 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 RB1P06400 928 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 SNHG28P0DPA3 235 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 GHRP10912 638 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 MX1P20591 662 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ARHGAP4P98171 946 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 SP4Q02446 784 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ADAM15Q13444 863 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 PNMA1Q8ND90 353 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 SCN5AQ14524 2016 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 A0A0D9SFI3 127 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ENPP3O14638 875 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 KDM4AO75164 1064 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 LGALS2P05162 132 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ZXDAP98168 799 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 TCF15Q12870 199 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 COL19A1Q14993 1142 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 TBC1D10CQ8IV04 446 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 IL31RAQ8NI17 732 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ESR2Q92731 530 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 EVI5LQ96CN4 794 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 NEDD4P46934 1319 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 C5orf67F2Z3F1 127 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 H0Y858 1186 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ZNF213O14771 459 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 OPLAHO14841 1288 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 PER2O15055 1255 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 CHRNA1P02708 482 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 GNAT1P11488 350 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 SP100P23497 879 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 DNAJB1P25685 340 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 CCND2P30279 289 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 NRIP1P48552 1158 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 VCPP55072 806 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 PGM5Q15124 567 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 DGKHQ86XP1 1220 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 TRIM50Q86XT4 487 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 HOMER1Q86YM7 354 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 FBXL6Q8N531 539 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 PIBF1Q8WXW3 757 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 APBB2Q92870 758 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 RILPL2Q969X0 211 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 APOL5Q9BWW9 433 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 AMNQ9BXJ7 453 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 TLR9Q9NR96 1032 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 CLEC1BQ9P126 229 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 MYH8P13535 1937 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-225ENST00000593072 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms