RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 GOPCQ9HD26 462 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO28Q9NVF7 368 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 NYAP2Q9P242 653 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ADORA2AP29274 412 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM132BQ14DG7 1078 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ARMCX5Q6P1M9 558 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 NYAP1Q6ZVC0 841 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 TNNT1P13805 278 aa28.55■■■□□ 2.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf49Q9H6J7 331 aa28.55■■■□□ 2.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.54■■■□□ 2.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMX1Q9H3N1 280 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 PARP14Q460N5 1801 aa28.54■■■□□ 2.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 NAPAP54920 295 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 PLS1Q14651 629 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ARID5BQ14865 1188 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 SYCP1Q15431 976 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 IL17AQ16552 155 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 OLFML2BQ68BL8 750 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 DPP9Q86TI2 863 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa28.54■■■□□ 2.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 F5H6K3 240 aa28.52■■■□□ 2.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 TTLL1O95922 423 aa28.52■■■□□ 2.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 KLRC3Q07444 240 aa28.52■■■□□ 2.16
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CAPNS1-204ENST00000587718 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.49■■■□□ 2.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R2P41236 205 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 STAT6P42226 847 aa28.48■■■□□ 2.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA8HP0CJ92 632 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF543Q08ER8 600 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 FILIP1LQ4L180 1135 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 C7orf61Q8IZ16 206 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 MAML3Q96JK9 1138 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 SLF1Q9BQI6 1058 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
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