RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 MCTP2Q6DN12 878 aa21.75■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 GTF3C6Q969F1 213 aa21.75■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.75■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 A0A1W2PPC1 479 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 CTDNEP1O95476 244 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 F2P00734 622 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 MFSD10Q14728 455 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 CEP55Q53EZ4 464 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 TDHQ8IZJ6 230 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 KIF2CQ99661 725 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 GPR20Q99678 358 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 STK36Q9NRP7 1315 aa21.74■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 MAFGO15525 162 aa21.73■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.73■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 CYP2C9P11712 490 aa21.73■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 CYP2C18P33260 490 aa21.73■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 C7orf31Q8N865 590 aa21.73■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 HIPK3Q9H422 1215 aa21.73■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.73■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 NOD1Q9Y239 953 aa21.73■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 KAT6AQ92794 2004 aa21.72■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 LGALS2P05162 132 aa21.72■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 ARP10275 920 aa21.72■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 FPGSQ05932 587 aa21.72■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.72■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.72■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.72■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.72■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 FAM86B1E9PN63 330 aa21.71■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 HAS3O00219 553 aa21.71■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.71■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 PTGISQ16647 500 aa21.71■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 MFSD5Q6N075 450 aa21.71■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.71■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 BLIDQ8IZY5 108 aa21.71■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 SDF4Q9BRK5 362 aa21.71■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.71■■□□□ 1.07
PKD1-232ENST00000566905 H3BRB1 525 aa21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 MEIS1O00470 390 aa21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 CYP3A4P08684 503 aa21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 XBP1P17861 261 aa21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 CCL23P55773 120 aa21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 SESTD1Q86VW0 696 aa21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 TRIM50Q86XT4 487 aa21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 TMEM199Q8N511 208 aa21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 UIMC1Q96RL1 719 aa21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.7■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 SCN5AQ14524 2016 aa21.69■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 EPHB4P54760 987 aa21.69■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 SHHQ15465 462 aa21.69■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.69■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.69■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 WASF1Q92558 559 aa21.69■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.69■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 JAK2O60674 1132 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 CSF2RAP15509 400 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 ST3GAL1Q11201 340 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 NPY5RQ15761 445 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 GALNT17Q6IS24 598 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 NFASCO94856 1347 aa21.68■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.67■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 FOSBP53539 338 aa21.67■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 RABEP1Q15276 862 aa21.67■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 PRR16Q569H4 304 aa21.67■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 TBCKQ8TEA7 893 aa21.67■■□□□ 1.06
PKD1-232ENST00000566905 SCLYQ96I15 445 aa21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms