RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	THPO	P40225	353 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	UBE2S	Q16763	222 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	USP26	Q9BXU7	913 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	TLL1	O43897	1013 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	FGD1	P98174	961 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	SEMA3F	Q13275	785 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	WNT8B	Q93098	351 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	TET1	Q8NFU7	2136 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	NBN	O60934	754 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	RBL2	Q08999	1139 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	GPR20	Q99678	358 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	HIC1	Q14526	733 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIM50	Q86XT4	487 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB43	O43298	467 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	IKBKE	Q14164	716 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	GPNMB	Q14956	572 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	RTN1	Q16799	776 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	APOA5	Q6Q788	366 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	CXCL10	P02778	98 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	RSPH10B	P0C881	870 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	GNAT1	P11488	350 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	KRT32	Q14532	448 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	SERINC5	Q86VE9	423 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	CDHR1	Q96JP9	859 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-208	ENST00000564966	RFXAP	O00287	272 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	TREH	O43280	583 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	CTSH	P09668	335 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	NAPA	P54920	295 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	RASEF	Q8IZ41	740 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	GPRASP2	Q96D09	838 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	SETD4	Q9NVD3	440 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	EMSY	Q7Z589	1322 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	LGR5	O75473	907 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	DEFB103A	P81534	67 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGAP4	P98171	946 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	THEG	Q9P2T0	379 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	EFCAB14	O75071	495 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	TAP1	Q03518	808 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	MTMR1	Q13613	665 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	MBTPS1	Q14703	1052 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	TCTN1	Q2MV58	587 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP9A	O75110	1047 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	ITGB5	P18084	799 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	IL27	Q8NEV9	243 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGEF15	O94989	841 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	ADCY7	P51828	1080 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	GLG1	Q92896	1179 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	PGBD1	Q96JS3	809 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP4C-208	ENST00000564966	LCHN	A4D1U4	455 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNA2	P16389	499 aa		29.01	■■■□□ 2.23

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