RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562291.2

INO80E-204, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-204ENST00000562291 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 LGALS2P05162 132 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 CKBP12277 381 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 FOSL2P15408 326 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 CDC27P30260 824 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 RABGGTBP53611 331 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 SP4Q02446 784 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 FUT2Q10981 343 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 BRF1Q92994 677 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 GPRASP2Q96D09 838 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 CDHR1Q96JP9 859 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 CTAGE1Q96RT6 745 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 GPR20Q99678 358 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 SLC28A3Q9HAS3 691 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 RIC8AQ9NPQ8 531 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
INO80E-204ENST00000562291 KIF28PB7ZC32 967 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ATP9AO75110 1047 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 GNAT1P11488 350 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ADCY7P51828 1080 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 RCAN1P53805 252 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 LRRC8DQ7L1W4 858 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 JADE2Q9NQC1 790 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 STXBP3O00186 592 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 MYOGP15173 224 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ITGB5P18084 799 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 RPS6KB1P23443 525 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ZNF76P36508 570 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 THPOP40225 353 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 KCNJ6P48051 423 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 MTMR1Q13613 665 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 HIC1Q14526 733 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ZNF618Q5T7W0 954 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 MXRA8Q9BRK3 442 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 PRDM12Q9H4Q4 367 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 SETD4Q9NVD3 440 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 BARHL2Q9NY43 387 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 DLL1O00548 723 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 TREHO43280 583 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 RSPH10BP0C881 870 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 KCNA2P16389 499 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 RBL2Q08999 1139 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 IKBKEQ14164 716 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 GPNMBQ14956 572 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 CNKSR3Q6P9H4 555 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 TEX2Q8IWB9 1127 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 FBXL16Q8N461 479 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 PGBD1Q96JS3 809 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 SLC9A7Q96T83 725 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 TMEM260Q9NX78 707 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 LAMA3Q16787 3333 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 SCN5AQ14524 2016 aa11.06□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 TET1Q8NFU7 2136 aa11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 NBNO60934 754 aa11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 BAIAP3O94812 1187 aa11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 CXCL10P02778 98 aa11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 SCG2P13521 617 aa11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 IGFBP4P22692 258 aa11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 CCT2P78371 535 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ARHGAP4P98171 946 aa11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.05□□□□□ -0.64
INO80E-204ENST00000562291 RUFY3Q7L099 469 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms