RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 SEPT4O43236 478 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSMD10O75832 226 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 YEATS4O95619 227 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 BMP15O95972 392 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 STK38Q15208 465 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.1■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 POTEFA5A3E0 1075 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 LAD1O00515 517 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 GAS7O60861 476 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 NEDD9Q14511 834 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTFR1Q15390 333 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 IL17AQ16552 155 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 RIT2Q99578 217 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 NFASCO94856 1347 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPTLC2O15270 562 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARHGAP1Q07960 439 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 SDF4Q9BRK5 362 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 GH1P01241 217 aa21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRPHP41219 470 aa21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 TECP42680 631 aa21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 SP4Q02446 784 aa21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRIN1Q05586 938 aa21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 METTL7BQ6UX53 244 aa21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 VAV3Q9UKW4 847 aa21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCNE2O96020 404 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 TLK2Q86UE8 772 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARMC5Q96C12 935 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF333Q96JL9 665 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPATA32Q96LK8 384 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHMP2AO43633 222 aa21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCL5P13501 91 aa21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLIC6Q96NY7 704 aa21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 POTEMA6NI47 508 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 EML1O00423 815 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP6R2O75170 966 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 RARBP10826 455 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP2R5CQ13362 524 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 LAMC2Q13753 1193 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 AFG1LQ8WV93 481 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPATA33Q96N06 139 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 Q9Y3F1 56 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 FRMPD3Q5JV73 1810 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACTR2P61160 394 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT76Q01546 638 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 LHX8Q68G74 356 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 FERMT2Q96AC1 680 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF208Q9H0X6 261 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.03■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.03■□□□□ 0.96
USP3-AS1-203ENST00000559737 PGK1P00558 417 aa21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms