RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 CEP68Q76N32 757 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 OTOP3Q7RTS5 596 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 NOSTRINQ8IVI9 506 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 CNTD1Q8N815 330 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 C2orf69Q8N8R5 385 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 ANKS4BQ8N8V4 417 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 BOCQ9BWV1 1114 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 IMPACTQ9P2X3 320 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 TRHDEQ9UKU6 1024 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 EID1Q9Y6B2 187 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 TAF6LQ9Y6J9 622 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 SLC12A8A0AV02 714 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 KCNK3O14649 394 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 GABRDO14764 452 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 KRT37O76014 449 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 EFEMP2O95967 443 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 HPXP02790 462 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 FUCA1P04066 466 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 MSL3P1P0C860 447 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 KRT15P19012 456 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 NEK2P51955 445 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 IRF9Q00978 393 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 OCRLQ01968 901 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 SPIRE1Q08AE8 756 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 FIGNQ5HY92 759 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 SYDE2Q5VT97 1194 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 IQSEC1Q6DN90 963 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 EFHBQ8N7U6 833 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 PDZD8Q8NEN9 1154 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 ABHD4Q8TB40 342 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 FAM84AQ96KN4 292 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 PLCD4Q9BRC7 762 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 OXSMQ9NWU1 459 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 SRPK3Q9UPE1 567 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-205ENST00000558714 NOTOA8MTQ0 251 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 H7C1D1 291 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 K7ESF4 209 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 MAN2B1O00754 1011 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 TGM5O43548 720 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 NRDCO43847 1150 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 ULK1O75385 1050 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 DGKIO75912 1065 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 COL6A2P12110 1019 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 TACR1P25103 407 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 ERVK-21P61565 698 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 CHRNEQ04844 493 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 MESP2Q0VG99 397 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 KIR3DS1Q14943 382 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 PKN1Q16512 942 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 MLANAQ16655 118 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 EMC4Q5J8M3 183 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 MROH9Q5TGP6 573 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 CCDC181Q5TID7 509 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 C11orf74Q86VG3 221 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 OSTM1Q86WC4 334 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 OXR1Q8N573 874 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 LZTR1Q8N653 840 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 MYLIPQ8WY64 445 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 SLC5A5Q92911 643 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 SLC38A3Q99624 504 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 YIPF4Q9BSR8 244 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 SHTN1A0MZ66 631 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 FITM1A5D6W6 292 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-205ENST00000558714 BTBD11A6QL63 1104 aa4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms