RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 GH2P01242 217 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 CYP11B2P19099 503 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 VAV2P52735 878 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 ARHGAP4P98171 946 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 MAP2K7O14733 419 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 CYP4A11Q02928 519 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 KIF5AQ12840 1032 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 TUBB2AQ13885 445 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 DEF6Q9H4E7 631 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 A0A1W2PRG0 241 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 ATP8B1O43520 1251 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 SPA17Q15506 151 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 MKL1Q969V6 931 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 TSG101Q99816 390 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 L1RE1Q9UN81 338 aa23.48■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 EHD2Q9NZN4 543 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 NYAP2Q9P242 653 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 AKR1B10O60218 316 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 CXCR5P32302 372 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 NOL4O94818 638 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 KIF20AO95235 890 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 ARID5AQ03989 594 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 PSMD2Q13200 908 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 OPLAHO14841 1288 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 NCK2O43639 380 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 ECE1P42892 770 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 C2orf54Q08AI8 447 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 COG1Q8WTW3 980 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 DCAF4Q8WV16 495 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 TBC1D5Q92609 795 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 LENG9Q96B70 501 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 HYIQ5T013 277 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 NEK11Q8NG66 645 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 IDI2Q9BXS1 227 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 IKZF4Q9H2S9 585 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TMEM260-216ENST00000557657 MYH10P35580 1976 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 TLR2O60603 784 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 RSPH10BP0C881 870 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 SLC12A3P55017 1021 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 CDK17Q00537 523 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 CAGE1Q8TC20 777 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 BUB1O43683 1085 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 POLD1P28340 1107 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 RASSF7Q02833 373 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 HGSNATQ68CP4 663 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 PDXDC1Q6P996 788 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 KCTD10Q9H3F6 313 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 USP11P51784 963 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 UBXN2AP68543 259 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 FBXO11Q86XK2 927 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 AMNQ9BXJ7 453 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 SH2D4AQ9H788 454 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 SLX4Q8IY92 1834 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 USP14P54578 494 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM260-216ENST00000557657 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms