RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	EOMES	O95936	686 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	AKR1B1	P15121	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RFX1	P22670	979 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SEPT8	Q92599	483 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	USP17L21	D6R901	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	FSCN2	O14926	492 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	APC2	O95996	2303 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PROSER1	Q86XN7	944 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ACACA	Q13085	2346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	LRP3	O75074	770 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	DGKI	O75912	1065 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RET	P07949	1114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	THPO	P40225	353 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	LIMK1	P53667	647 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	KPNA6	O60684	536 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ARIH2	O95376	493 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	GATM	P50440	423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RAD21	O60216	631 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CIAO1	O76071	339 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CTSH	P09668	335 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CYP2D6	P10635	497 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	MTHFR	P42898	656 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	USP5	P45974	858 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	HCST	Q9UBK5	93 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	RELN	P78509	3460 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	ITIH3	Q06033	890 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	CRELD1	Q96HD1	420 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	TDGF1	P13385	188 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	TROAP	Q12815	778 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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