RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	SCLY	Q96I15	445 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	GPR20	Q99678	358 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	LGALS2	P05162	132 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	KCNA2	P16389	499 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	DNAJB2	P25686	324 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	GPNMB	Q14956	572 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	NTRK3	Q16288	839 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	UBE2S	Q16763	222 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ATP9A	O75110	1047 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	SCG2	P13521	617 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	SELP	P16109	830 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	SREBF1	P36956	1147 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ADCY7	P51828	1080 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	HIC1	Q14526	733 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PKN1	Q16512	942 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CS-223	ENST00000551137	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	MEIS1	O00470	390 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CXCL10	P02778	98 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CKB	P12277	381 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ACTN1	P12814	892 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	IFNAR1	P17181	557 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ADAM17	P78536	824 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	MTMR1	Q13613	665 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	RAB30	Q15771	203 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CDH23	Q9H251	3354 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	NFASC	O94856	1347 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SORBS3	O60504	671 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CAND2	O75155	1236 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CYP3A4	P08684	503 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ANAPC15	P60006	121 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	MSRA	Q9UJ68	235 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	TRANK1	O15050	2925 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	GNAT1	P11488	350 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	GNA11	P29992	359 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	PBX2	P40425	430 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CS-223	ENST00000551137	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31

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