RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LETMD1-223	ENST00000550442	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LETMD1-223	ENST00000550442	RAD54L	Q92698	747 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LETMD1-223	ENST00000550442	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LETMD1-223	ENST00000550442	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
LETMD1-223	ENST00000550442	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
LETMD1-223	ENST00000550442	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LETMD1-223	ENST00000550442	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
LETMD1-223	ENST00000550442	CYP3A4	P08684	503 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TXK	P42681	527 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ASIC1	P78348	528 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	UBXN1	Q04323	297 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ICA1	Q05084	483 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	RBL2	Q08999	1139 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF592	Q92610	1267 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	CEP63	Q96MT8	703 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM232	C9JQI7	657 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442		F5H6K3	240 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	FDX1	P10109	184 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	PRMT2	P55345	433 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ZBED6	P86452	979 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	KLRC3	Q07444	240 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM160B2	Q86V87	743 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPN18	Q99952	460 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	EVI5	O60447	810 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	GNRH1	P01148	92 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	BMP3	P12645	472 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	STX17	P56962	302 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	EHHADH	Q08426	723 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MEA1	Q16626	185 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	CEP112	Q8N8E3	955 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MNS1	Q8NEH6	495 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	UBXN4	Q92575	508 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	KCND2	Q9NZV8	630 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	GYPC	P04921	128 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	CASP14	P31944	242 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT9	P35527	623 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	GJA5	P36382	358 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	SREBF1	P36956	1147 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	GJA8	P48165	433 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TNNI2	P48788	182 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LETMD1-223	ENST00000550442	GRB10	Q13322	594 aa		13.11	□□□□□ -0.31

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