RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 SLC12A7Q9Y666 1083 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 PTPDC1A2A3K4 754 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 ADAMTS4O75173 837 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 CFHP08603 1231 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 AKR1A1P14550 325 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 RABGGTBP53611 331 aa11.16□□□□□ -0.62
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CS-217ENST00000550044 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.16□□□□□ -0.62
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CS-217ENST00000550044 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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CS-217ENST00000550044 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 A6NJR5 290 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 CYTH3O43739 400 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 GPR37L1O60883 481 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 DDAH1O94760 285 aa11.15□□□□□ -0.62
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CS-217ENST00000550044 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 CASTP20810 708 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 CALML3P27482 149 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 Q6ZUG5 572 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 FAM133AQ8N9E0 248 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 FANCBQ8NB91 859 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-217ENST00000550044 HERVK_113Q902F9 699 aa11.15□□□□□ -0.62
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CS-217ENST00000550044 PNMA2Q9UL42 364 aa11.15□□□□□ -0.62
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CS-217ENST00000550044 MYADML2A6NDP7 307 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 ZBTB5O15062 677 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 CALM1P0DP23 149 aa11.14□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 MRE11P49959 708 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 APOBRQ0VD83 1088 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 KCNA10Q16322 511 aa11.14□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 RNF207Q6ZRF8 634 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 OTOP2Q7RTS6 562 aa11.14□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 MAP3K14Q99558 947 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 AMNQ9BXJ7 453 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 IL23AQ9NPF7 189 aa11.14□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.13□□□□□ -0.63
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CS-217ENST00000550044 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 CNPY2Q9Y2B0 182 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-217ENST00000550044 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
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