RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 HAS1Q92839 578 aa29.02■■■□□ 2.24
STIP1-208ENST00000540501 SPATA32Q96LK8 384 aa29.02■■■□□ 2.24
STIP1-208ENST00000540501 GBP4Q96PP9 640 aa29.02■■■□□ 2.24
STIP1-208ENST00000540501 PDGFCQ9NRA1 345 aa29.02■■■□□ 2.24
STIP1-208ENST00000540501 SEPT4O43236 478 aa29.01■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 MSCO60682 206 aa29.01■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 ADCYAP1R1P41586 468 aa29.01■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 STK24Q9Y6E0 443 aa29.01■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 PSMD10O75832 226 aa29■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 GH1P01241 217 aa29■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 TXKP42681 527 aa29■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 KRT76Q01546 638 aa29■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 LAMC2Q13753 1193 aa29■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 METTL7BQ6UX53 244 aa29■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 MLXIPQ9HAP2 919 aa29■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 ATP9AO75110 1047 aa28.99■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.233e-7■■■□□ 18.5
STIP1-208ENST00000540501 PDIA5Q14554 519 aa28.99■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 ARIH2O95376 493 aa28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 GGPS1O95749 300 aa28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 CNGA1P29973 690 aa28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 LY6KQ17RY6 165 aa28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 RDM1Q8NG50 284 aa28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.98■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 DHX15O43143 795 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 SMPD1P17405 629 aa28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 SFNP31947 248 aa28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 SP2Q02086 613 aa28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 TRIM32Q13049 653 aa28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 PPP2R5CQ13362 524 aa28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 TRPV1Q8NER1 839 aa28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 AK8Q96MA6 479 aa28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.97■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 ELP1O95163 1332 aa28.96■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 RARBP10826 455 aa28.96■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 LONP1P36776 959 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 JAK3P52333 1124 aa28.96■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.96■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 AP5M1Q9H0R1 490 aa28.96■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 SPC25Q9HBM1 224 aa28.96■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
STIP1-208ENST00000540501 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 SH3TC2Q8TF17 1288 aa28.95■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 DOCK5Q9H7D0 1870 aa28.94■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 VWA3AA6NCI4 1184 aa28.94■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 GOLGA6L22H0YM25 854 aa28.94■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 CUTAO60888 179 aa28.94■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 TECP42680 631 aa28.94■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 ME1P48163 572 aa28.94■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 IGSF22Q8N9C0 903 aa28.94■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 OR6J1Q8NGC5 347 aa28.94■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 WDR64B1ANS9 1081 aa28.93■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 NOP56O00567 594 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 ARHGAP1Q07960 439 aa28.93■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 B3GNT9Q6UX72 402 aa28.93■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 ERMNQ8TAM6 284 aa28.93■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 ARMC5Q96C12 935 aa28.93■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 ABHD8Q96I13 439 aa28.93■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 VAV3Q9UKW4 847 aa28.93■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 SLC26A4O43511 780 aa28.92■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 MIER3Q7Z3K6 550 aa28.92■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 TLK2Q86UE8 772 aa28.92■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 PPTC7Q8NI37 304 aa28.92■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.92■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 SPATA33Q96N06 139 aa28.92■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 LRWD1Q9UFC0 647 aa28.92■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 CAPN2P17655 700 aa28.91■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 CPT1AP50416 773 aa28.91■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 SPIRE1Q08AE8 756 aa28.91■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 EPHA7Q15375 998 aa28.91■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 HAUS3Q68CZ6 603 aa28.91■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 ADALQ6DHV7 355 aa28.91■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa28.91■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 TMEM87AQ8NBN3 555 aa28.91■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 NEK9Q8TD19 979 aa28.91■■■□□ 2.22
STIP1-208ENST00000540501 COPS5Q92905 334 aa28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms