RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 TXKP42681 527 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 PDIA5Q14554 519 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 IL17AQ16552 155 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 VAV3Q9UKW4 847 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 GAS7O60861 476 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP2R5CQ13362 524 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 SDF4Q9BRK5 362 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 ME1P48163 572 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 METTL7BQ6UX53 244 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 GJA10Q969M2 543 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 AK8Q96MA6 479 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB34Q9BZG1 259 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.83■■□□□ 1.57
PACSIN3-205ENST00000528462 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 LY6KQ17RY6 165 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 TRPV1Q8NER1 839 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.82■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 CUTAO60888 179 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT76Q01546 638 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 ADALQ6DHV7 355 aa24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 SEPT4O43236 478 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 AKR1A1P14550 325 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 SMPD1P17405 629 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 TECP42680 631 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 TNFAIP2Q03169 654 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM32Q13049 653 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 PKD2L1Q9P0L9 805 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 Q9Y3F1 56 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 GGPS1O95749 300 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 INHAP05111 366 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 GRIN1Q05586 938 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 RDM1Q8NG50 284 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 UIMC1Q96RL1 719 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.8■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 GH1P01241 217 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 LAMC2Q13753 1193 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 STK24Q9Y6E0 443 aa24.79■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PQ27 194 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PQ64 194 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PQD8 194 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 ADCY6O43306 1168 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 SFNP31947 248 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGAP1Q07960 439 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 CLIC6Q96NY7 704 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 CSRNP2Q9H175 543 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.78■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR64B1ANS9 1081 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 CCNE2O96020 404 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 JAK3P52333 1124 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-205ENST00000528462 POTEMA6NI47 508 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 ATG7O95352 703 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 MSCO60682 206 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 CMA1P23946 247 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 ACTR2P61160 394 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 NKX3-2P78367 333 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 SHC4Q6S5L8 630 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 PPTC7Q8NI37 304 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 COPS5Q92905 334 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 DISC1Q9NRI5 854 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 EML1O00423 815 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC26A4O43511 780 aa24.75■■□□□ 1.55
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