RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 ECI1P42126 302 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 KCNMB1Q16558 191 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 IQCEQ6IPM2 695 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 JMYQ8N9B5 988 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 FRS2Q8WU20 508 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 IER2Q9BTL4 223 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 CLEC1BQ9P126 229 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 GPR160Q9UJ42 338 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 GLI1P08151 1106 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 PLS3P13797 630 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 L1CAMP32004 1257 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 TESK1Q15569 626 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 MCTP1Q6DN14 999 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 NLRX1Q86UT6 975 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 UNC5CLQ8IV45 518 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 ASIC4Q96FT7 647 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 SLIT2O94813 1529 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 PRODHO43272 600 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 DLX3O60479 287 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 CORO7P57737 925 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 LAPTM5Q13571 262 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 NSMFQ6X4W1 530 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 NLGN2Q8NFZ4 835 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 FAM168AQ92567 244 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 OSBP2Q969R2 916 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 SHISA4Q96DD7 197 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 C1orf159Q96HA4 380 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 RNF32Q9H0A6 362 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 PIF1Q9H611 641 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 TULP4Q9NRJ4 1543 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 FAM153BP0C7A2 387 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-225ENST00000515835 EFEMP2O95967 443 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 PNLIPP16233 465 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 KCNAB2Q13303 367 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 LILRB2Q8N423 598 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 CDC6Q99741 560 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 USP32Q8NFA0 1604 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PQ27 194 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PQ64 194 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PQC6 194 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PQD8 194 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 NPHS1O60500 1241 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 PRKCAP17252 672 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 LTBRP36941 435 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 VPS72Q15906 364 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 C2orf27AQ580R0 203 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 NUP43Q8NFH3 380 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 DIO2Q92813 273 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 C7orf72A4D263 438 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 ARL4AP40617 200 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 CYP4F8P98187 520 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 MVKQ03426 396 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 ATP7BP35670 1465 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 ARNTLO00327 626 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 INF2Q27J81 1249 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-225ENST00000515835 MBLAC2Q68D91 279 aa8.49□□□□□ -1.05
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