RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 CRACR2AQ9BSW2 395 aa12.23□□□□□ -0.45
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RABGEF1-208ENST00000510829 PIM2Q9P1W9 311 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-208ENST00000510829 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa12.23□□□□□ -0.45
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RABGEF1-208ENST00000510829 CYP3A7P24462 503 aa12.22□□□□□ -0.45
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RABGEF1-208ENST00000510829 TBX3O15119 743 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-208ENST00000510829 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.457e-9■■■□□ 16.7
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RABGEF1-208ENST00000510829 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-208ENST00000510829 CDC23Q9UJX2 597 aa12.21□□□□□ -0.45
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RABGEF1-208ENST00000510829 SFI1A8K8P3 1242 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM13AO94988 1023 aa12.21□□□□□ -0.46
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RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF577Q9BSK1 485 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
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RABGEF1-208ENST00000510829 C10orf71Q711Q0 1435 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 MYH7BA7E2Y1 1941 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SHTN1A0MZ66 631 aa12.19□□□□□ -0.46
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