RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 B4GALT4O60513 344 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 ZNF623O75123 536 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 COL6A1P12109 1028 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 STEAP3Q658P3 488 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 PROSER1Q86XN7 944 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 NUDT11Q96G61 164 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 C1orf159Q96HA4 380 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 SPATA32Q96LK8 384 aa4.07□□□□□ -1.76
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RBM39-242ENST00000498280 JAM3Q9BX67 310 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 DTLQ9NZJ0 730 aa4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 ZNF652Q9Y2D9 606 aa4.07□□□□□ -1.76
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RBM39-242ENST00000498280 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 MSCO60682 206 aa4.06□□□□□ -1.76
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RBM39-242ENST00000498280 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 SV2CQ496J9 727 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 PPIL6Q8IXY8 311 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
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RBM39-242ENST00000498280 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 CLDND1Q9NY35 253 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 ZDHHC9Q9Y397 364 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa4.06□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 UNCXA6NJT0 531 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 ZNF202O95125 648 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 LTFP02788 710 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 HOXC12P31275 282 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 KCNJ6P48051 423 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 GFRA1P56159 465 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 NFATC3Q12968 1075 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 LSAMPQ13449 338 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 NCAPHQ15003 741 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 MIIPQ5JXC2 388 aa4.05□□□□□ -1.76
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RBM39-242ENST00000498280 ZNF575Q86XF7 245 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 FAM178BQ8IXR5 827 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 KLHL36Q8N4N3 616 aa4.05□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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RBM39-242ENST00000498280 CHFRQ96EP1 664 aa4.05□□□□□ -1.76
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RBM39-242ENST00000498280 EMC4Q5J8M3 183 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.04□□□□□ -1.76
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RBM39-242ENST00000498280 ASH2LQ9UBL3 628 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-242ENST00000498280 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa4.03□□□□□ -1.76
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RBM39-242ENST00000498280 DGKIO75912 1065 aa4.02□□□□□ -1.77
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