RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		19.8	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	EFCAB14	O75071	495 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL10	P02778	98 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	GNAT1	P11488	350 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	AP3B2	Q13367	1082 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZUG5	572 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC9A7	Q96T83	725 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR20	Q99678	358 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	SCN5A	Q14524	2016 aa		19.78	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	19.78	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	ESYT2	A0FGR8	921 aa		19.78	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALS2	P05162	132 aa		19.78	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		19.78	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		19.78	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		19.78	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	SERINC5	Q86VE9	423 aa		19.78	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		19.78	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	JADE2	Q9NQC1	790 aa		19.78	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		19.78	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	CKB	P12277	381 aa		19.77	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	19.77	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	NAPA	P54920	295 aa		19.77	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	19.77	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		19.77	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	19.77	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		19.77	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	19.77	■□□□□ 0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	EMSY	Q7Z589	1322 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	STXBP3	O00186	592 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC24B	O95487	1268 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF286B	P0CG31	522 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	CPA1	P15085	419 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNA2	P16389	499 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGB5	P18084	799 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC27	P30260	824 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	MTMR1	Q13613	665 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD1	Q15327	319 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	RPAIN	Q86UA6	219 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	BRF1	Q92994	677 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ALG1	Q9BT22	464 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		19.76	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		19.75	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	19.75	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ADCY7	P51828	1080 aa		19.75	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		19.75	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		19.75	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		19.75	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	NFASC	O94856	1347 aa		19.75	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	NRCAM	Q92823	1304 aa		19.75	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	SMCO2	A6NFE2	343 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	DLL1	O00548	723 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	SCG2	P13521	617 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	SREBF1	P36956	1147 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	CHMP4BP1	P59074	171 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM17	P78536	824 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	GPNMB	Q14956	572 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP55	Q53EZ4	464 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		19.74	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBBX	A8MT70	800 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF28P	B7ZC32	967 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	MEIS1	O00470	390 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP3A4	P08684	503 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNAR1	P17181	557 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	GNA11	P29992	359 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	APOBR	Q0VD83	1088 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIN2C	Q14957	1233 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2S	Q16763	222 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		19.73	■□□□□ 0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		19.73	■□□□□ 0.75

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