RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480996.1

KDM4C-208, Transcript of lysine demethylase 4C, human

TSL 3

Gene KDM4C, Length 405 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4C-208	ENST00000480996	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MEIS1	O00470	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	HIP1R	O75146	1068 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	BDNF	P23560	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	RXRB	P28702	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DDIT3	P35638	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	HAL	P42357	657 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CTSK	P43235	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SCAND1	P57086	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM193A	P78312	1265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PHC1	P78364	1004 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GRIK4	Q16099	956 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SVOP	Q8N4V2	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	USP21	Q9UK80	565 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	FZD9	O00144	591 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ARNTL	O00327	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	WNT9A	O14904	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC26A4	O43511	780 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CBX7	O95931	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ZBED1	O96006	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SOD2	P04179	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CKM	P06732	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	BMP3	P12645	472 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	RHCE	P18577	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	BMP8B	P34820	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GMPR	P36959	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GTF2A2	P52657	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	RHD	Q02161	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LRRC32	Q14392	662 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF787	Q6DD87	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CCT6B	Q92526	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	C9orf172	C9J069	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LEFTY1	O75610	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ARHGEF15	O94989	841 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	HRG	P04196	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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