RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	CNST	Q6PJW8	725 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	KDELC1	Q6UW63	502 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PI16	Q6UXB8	463 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CNTD1	Q8N815	330 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SHD	Q96IW2	340 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SH3GL1	Q99961	368 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PLVAP	Q9BX97	442 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	VCPKMT	Q9H867	229 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	AKNA	Q7Z591	1439 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	OPLAH	O14841	1288 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FSCN2	O14926	492 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ZBED4	O75132	1171 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	MICAL2	O94851	1124 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PF4V1	P10720	104 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	RPS6KB1	P23443	525 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	MCM4	P33991	863 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SOX9	P48436	509 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CLCN2	P51788	898 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	BNIP1	Q12981	228 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NEDD9	Q14511	834 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ARID5B	Q14865	1188 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	HHAT	Q5VTY9	493 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	USP51	Q70EK9	711 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	VSIG1	Q86XK7	387 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SPERT	Q8NA61	448 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SHC3	Q92529	594 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TNIP3	Q96KP6	325 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	WDR24	Q96S15	920 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TNMD	Q9H2S6	317 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	DACT1	Q9NYF0	836 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CDC23	Q9UJX2	597 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	EDAR	Q9UNE0	448 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ABCC9	O60706	1549 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398		A0A087WZG4	1122 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	AP3B1	O00203	1094 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	BIN1	O00499	593 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB14	O43829	449 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TADA3	O75528	432 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	GOSR1	O95249	250 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ALDH1A1	P00352	501 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ADH1A	P07327	375 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ADH7	P40394	386 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ZAP70	P43403	619 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ATP5O	P48047	213 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TUB	P50607	506 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	USP11	P51784	963 aa		3.61	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms