RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 CCL14Q16627 93 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-209ENST00000469025 XKR5Q6UX68 686 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-209ENST00000469025 Q6ZS46 218 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-209ENST00000469025 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-209ENST00000469025 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-209ENST00000469025 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
OPTN-209ENST00000469025 CEP120Q8N960 986 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-209ENST00000469025 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-209ENST00000469025 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
OPTN-209ENST00000469025 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-209ENST00000469025 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-209ENST00000469025 LAMA5O15230 3695 aa7.03□□□□□ -1.28
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OPTN-209ENST00000469025 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 SLC30A4O14863 429 aa7.02□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 MBTPS2O43462 519 aa7.02□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 PDGFAP04085 211 aa7.02□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 MPSTP25325 297 aa7.02□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
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OPTN-209ENST00000469025 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
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OPTN-209ENST00000469025 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 APBA2Q99767 749 aa7.02□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 CNTN3Q9P232 1028 aa7.02□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.02□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 POLKQ9UBT6 870 aa7.02□□□□□ -1.29
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OPTN-209ENST00000469025 SIP14410 1827 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 MED23Q9ULK4 1368 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 LINC01387J3KSC0 135 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 ALX3O95076 343 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 PTPRAP18433 802 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 CNGA1P29973 690 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 RGS2P41220 211 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 ARTNQ5T4W7 220 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 MFSD14CQ5VZR4 134 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 TMEM39BQ9GZU3 492 aa7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 RELNP78509 3460 aa7□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 EPHA1P21709 976 aa7□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 ICAM3P32942 547 aa7□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 CLCN5P51795 746 aa7□□□□□ -1.29
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OPTN-209ENST00000469025 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 MTMR7Q9Y216 660 aa7□□□□□ -1.29
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OPTN-209ENST00000469025 POLQO75417 2590 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 TM4SF5O14894 197 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 NPR3P17342 541 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 CES1P23141 567 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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OPTN-209ENST00000469025 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 PTPN21Q16825 1174 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 C8orf34Q49A92 452 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 SPRED2Q7Z698 418 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 NETO1Q8TDF5 533 aa6.99□□□□□ -1.29
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OPTN-209ENST00000469025 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.99□□□□□ -1.29
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OPTN-209ENST00000469025 MYO7AQ13402 2215 aa6.99□□□□□ -1.29
OPTN-209ENST00000469025 A6NHS1 94 aa6.98□□□□□ -1.29
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OPTN-209ENST00000469025 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.98□□□□□ -1.29
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OPTN-209ENST00000469025 TRPV1Q8NER1 839 aa6.98□□□□□ -1.29
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