RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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SNHG12-201ENST00000461448 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.1■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.1■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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SNHG12-201ENST00000461448 DEFB118Q96PH6 123 aa22.1■■□□□ 1.13
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SNHG12-201ENST00000461448 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.1■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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SNHG12-201ENST00000461448 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.1■■□□□ 1.13
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SNHG12-201ENST00000461448 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.09■■□□□ 1.13
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SNHG12-201ENST00000461448 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 HTTP42858 3142 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGAP1Q07960 439 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 SLC39A14Q15043 492 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 SLC5A5Q92911 643 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 Q9Y3F1 56 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 GAS7O60861 476 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 PGK1P00558 417 aa22.08■■□□□ 1.13
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SNHG12-201ENST00000461448 OR52Z1P0C646 297 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 PRPHP41219 470 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 SP4Q02446 784 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 LAMC2Q13753 1193 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 LHX8Q68G74 356 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 HAS1Q92839 578 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 SPATA32Q96LK8 384 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 SPC25Q9HBM1 224 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 NFASCO94856 1347 aa22.08■■□□□ 1.12
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SNHG12-201ENST00000461448 METTL7BQ6UX53 244 aa22.07■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 SPATA33Q96N06 139 aa22.07■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 MTMR9Q96QG7 549 aa22.07■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 RIT2Q99578 217 aa22.07■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.07■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.07■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.07■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.07■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 SPTLC2O15270 562 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 PPP6R2O75170 966 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 PTPAQ15257 358 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 FERMT2Q96AC1 680 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 PSMD10O75832 226 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 GJB1P08034 283 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 GJA9P57773 515 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.06■■□□□ 1.12
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SNHG12-201ENST00000461448 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.05■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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SNHG12-201ENST00000461448 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.05■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.04■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 CHMP2AO43633 222 aa22.04■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 SGPL1O95470 568 aa22.04■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.04■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.04■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 MYADML2A6NDP7 307 aa22.03■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 ADAMTS4O75173 837 aa22.03■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 CPT1AP50416 773 aa22.03■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 KRT76Q01546 638 aa22.03■■□□□ 1.12
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