RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 DSG1Q02413 1049 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 BTKQ06187 659 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 RING1Q06587 406 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 TTLL4Q14679 1199 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 GRM3Q14832 879 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PRR16Q569H4 304 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 C7orf61Q8IZ16 206 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PDILTQ8N807 584 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM181AQ8N9Y4 354 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 NETO1Q8TDF5 533 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 BTN2A2Q8WVV5 523 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 EMC7Q9NPA0 242 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 MKS1Q9NXB0 559 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PRR13Q9NZ81 148 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 TJP2Q9UDY2 1190 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM50BQ9Y247 325 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 CFAP69A5D8W1 941 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIM75PA6NK02 468 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PRRT4C9JH25 899 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 FZD9O00144 591 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 GSTA4O15217 222 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PMM2O15305 246 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 TBX1O43435 398 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 TIMM44O43615 452 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF862O60290 1169 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 OFD1O75665 1012 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNH1O95259 989 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 ASGR2P07307 311 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 CAP2P40123 477 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 BNIP3Q12983 259 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 DCAF15Q66K64 600 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PGM2L1Q6PCE3 622 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 SRLQ86TD4 932 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 C12orf40Q86WS4 652 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 VPS37AQ8NEZ2 397 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIM63Q969Q1 353 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 RNF38Q9H0F5 515 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 AS3MTQ9HBK9 375 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 GP6Q9HCN6 339 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 CYP26B1Q9NR63 512 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 DISC1Q9NRI5 854 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 DMTF1Q9Y222 760 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 KLHL33A6NCF5 533 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PAPLNO95428 1278 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 HRGP04196 525 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 C8AP07357 584 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 LDHCP07864 332 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 RHCEP18577 417 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 SERPINB3P29508 390 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR85P60893 370 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 RHDQ02161 417 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PRKCQQ04759 706 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 NTRK3Q16288 839 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 NBPF9Q3BBW0 867 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM47CQ5HY64 1035 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-205ENST00000460278 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms