RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 METTL7BQ6UX53 244 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM50Q86XT4 487 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 C7orf31Q8N865 590 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 RASGRP4Q8TDF6 673 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 GPRASP2Q96D09 838 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 UIMC1Q96RL1 719 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR20Q99678 358 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 IL23AQ9NPF7 189 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 VPS54Q9P1Q0 977 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNA2P16389 499 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 MTMR1Q13613 665 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 VWCEQ96DN2 955 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 EHMT1Q9H9B1 1298 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 JADE2Q9NQC1 790 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 SCN5AQ14524 2016 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 MXRA8Q9BRK3 442 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5-208ENST00000459627 ARP10275 920 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 DEFB128Q7Z7B8 93 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 SESTD1Q86VW0 696 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 DEFB123Q8N688 67 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM161BQ96MY7 647 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 AIFM3Q96NN9 605 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 SENP7Q9BQF6 1050 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 FOSP01100 380 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 AK2P54819 239 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 OTOP2Q7RTS6 562 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 WNT8BQ93098 351 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 ZMYND12Q9H0C1 365 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 C6orf50Q9HD87 102 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 GRXCR1A8MXD5 290 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 H3BRB1 525 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 CPLX1O14810 134 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 SREBF1P36956 1147 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 ANAPC15P60006 121 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 SCRN1Q12765 414 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 AP3B2Q13367 1082 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNH7Q9NS40 1196 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 ESYT2A0FGR8 921 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 FGBP02675 491 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF76P36508 570 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGAP4P98171 946 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 RETREG2Q8NC44 543 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 CDHR1Q96JP9 859 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 LARGE1O95461 756 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 IQCF3P0C7M6 154 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 BFSP2Q13515 415 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 CEP55Q53EZ4 464 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM22Q8IYM9 498 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM86B1E9PN63 330 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM86B2P0C5J1 330 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 MARK3P27448 753 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 NLRP5P59047 1200 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 NECAB1Q8N987 351 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 RNPEPQ9H4A4 650 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 SETD4Q9NVD3 440 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 TANC1Q9C0D5 1861 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 C17orf102A2RUQ5 167 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 C8orf34Q49A92 452 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 RASIP1Q5U651 963 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 PLA2G4DQ86XP0 818 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 HERVK_113Q902F9 699 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 ZBBXA8MT70 800 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 MEIS1O00470 390 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 PITPNM1O00562 1244 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 TREHO43280 583 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 PFKFB2O60825 505 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 DEXIO95424 95 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 CKBP12277 381 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 GNA11P29992 359 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 PBX2P40425 430 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 NEK4P51957 841 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR153Q6NV75 609 aa27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms