RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 PLS3P13797 630 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 SEPHS1P49903 392 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 GTF2A2P52657 109 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 BTKQ06187 659 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 LLGL1Q15334 1064 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 DUSP27Q5VZP5 1158 aa5.73□□□□□ -1.49
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CBX1P4-201ENST00000439415 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM169Q96HH4 297 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 SGCZQ96LD1 299 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K14Q99558 947 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
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CBX1P4-201ENST00000439415 FNIP2Q9P278 1114 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa5.73□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC12A8A0AV02 714 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM227AF5H4B4 570 aa5.72□□□□□ -1.49
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CBX1P4-201ENST00000439415 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
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CBX1P4-201ENST00000439415 DRD2P14416 443 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC9A1P19634 815 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 GRK3P35626 688 aa5.72□□□□□ -1.49
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CBX1P4-201ENST00000439415 ELF2Q15723 593 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA5Q8NB90 893 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
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CBX1P4-201ENST00000439415 ACAP3Q96P50 834 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 ORAI2Q96SN7 254 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 MMP19Q99542 508 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 RSAD1Q9HA92 442 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 TOMM22Q9NS69 142 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 CLEC1BQ9P126 229 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 PGAP2Q9UHJ9 254 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 NRBP1Q9UHY1 535 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 CBLCQ9ULV8 474 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.72□□□□□ -1.49
CBX1P4-201ENST00000439415 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 TUSC2O75896 110 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 TIAF1O95411 115 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 IFNGR1P15260 489 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 AGXTP21549 392 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 DDIT3P35638 169 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 CTSKP43235 329 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 SEMA5AQ13591 1074 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 PDCD1Q15116 288 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 RCSD1Q6JBY9 416 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 TREML4Q6UXN2 200 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 DEPTORQ8TB45 409 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 CCT6BQ92526 530 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 MPP4Q96JB8 637 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 COX4I2Q96KJ9 171 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.71□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BML4 177 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 KDM1AO60341 852 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 WISP1O95388 367 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 C5AR1P21730 350 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 CD40P25942 277 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 IRF9Q00978 393 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM14Q14142 442 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 EEF1DP3Q658K8 133 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC174Q6PII3 467 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 ACAD11Q709F0 780 aa5.7□□□□□ -1.5
CBX1P4-201ENST00000439415 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
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