RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 PICK1Q9NRD5 415 aa25.82■■□□□ 1.72
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FAAP20-209ENST00000428120 LGALS16A8MUM7 142 aa25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
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FAAP20-209ENST00000428120 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.82■■□□□ 1.72
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FAAP20-209ENST00000428120 GPC2Q8N158 579 aa25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.82■■□□□ 1.72
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FAAP20-209ENST00000428120 PANX2Q96RD6 677 aa25.81■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.81■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 DOCK1Q14185 1865 aa25.81■■□□□ 1.72
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FAAP20-209ENST00000428120 MB21D1Q8N884 522 aa25.81■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.81■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.81■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 SLC26A4O43511 780 aa25.8■■□□□ 1.72
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FAAP20-209ENST00000428120 ERCC3P19447 782 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 IL31RAQ8NI17 732 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 TSC1Q92574 1164 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 DESI2Q9BSY9 194 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
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FAAP20-209ENST00000428120 USP14P54578 494 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 HMGCS2P54868 508 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 SLC5A5Q92911 643 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 POLD4Q9HCU8 107 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 ATG4CQ96DT6 458 aa25.79■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 CNGA4Q8IV77 575 aa25.79■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.79■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.79■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa25.79■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
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FAAP20-209ENST00000428120 ITGB5P18084 799 aa25.78■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 TPH2Q8IWU9 490 aa25.78■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.78■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
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FAAP20-209ENST00000428120 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 DYDC2Q96IM9 177 aa25.77■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 REEP2Q9BRK0 252 aa25.77■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 SPON1Q9HCB6 807 aa25.77■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25.77■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.77■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.77■■□□□ 1.72
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FAAP20-209ENST00000428120 VWA5AO00534 786 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB39O15060 712 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 SLITRK3O94933 977 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 PPP2R5CQ13362 524 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 MIIPQ5JXC2 388 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 KLRG1Q96E93 195 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 ZBED4O75132 1171 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 KLK7P49862 253 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC63Q05C16 580 aa25.76■■□□□ 1.71
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FAAP20-209ENST00000428120 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 ABHD10Q9NUJ1 306 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 STK24Q9Y6E0 443 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 DNM2P50570 870 aa25.75■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.75■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.75■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.75■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa25.75■■□□□ 1.71
FAAP20-209ENST00000428120 TTC26A0AVF1 554 aa25.75■■□□□ 1.71
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