RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GALNTL6	Q49A17	601 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT12	Q99456	494 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZPR1	O75312	459 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POLD1	P28340	1107 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAD23B	P54727	409 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COPS2	P61201	443 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLS1	Q14651	629 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CENPT	Q96BT3	561 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POTEA	Q6S8J7	498 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TLR10	Q9BXR5	811 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAB17	Q9H0T7	212 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMCO1	Q9UM00	188 aa		11.45	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CALB2	P22676	271 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF131	P52739	623 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BNIP1	Q12981	228 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LAMA4	Q16363	1823 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MME	P08473	750 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPAG1	Q07617	926 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDIA6	Q15084	440 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCNJL	Q8IV13	435 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FBF1	Q8TES7	1133 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC35B4	Q969S0	331 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PBK	Q96KB5	322 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SH2D4A	Q9H788	454 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SUN2	Q9UH99	717 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		11.44	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYH10	P35580	1976 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PFDN1	O60925	122 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BAG3	O95817	575 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHN1	P15882	459 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACADS	P16219	412 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ECHS1	P30084	290 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GBP1	P32455	592 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASRGL1	Q7L266	308 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PNMA3	Q9UL41	463 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A087X0B3	334 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM221	A6NGB7	291 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAD51C	O43502	376 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP46	P62068	366 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPA17	Q15506	151 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT71	Q3SY84	523 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RETREG2	Q8NC44	543 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PAGE5	Q96GU1	130 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IFT74	Q96LB3	600 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.43	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WFS1	O76024	890 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANXA1	P04083	346 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FUT4	P22083	530 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MCL1	Q07820	350 aa		11.42	□□□□□ -0.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.42	□□□□□ -0.58

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