RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ADCY1Q08828 1119 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 NIM1KQ8IY84 436 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 AMNQ9BXJ7 453 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 DRC3Q9H069 523 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 DISC1Q9NRI5 854 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 STAP2Q9UGK3 403 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RGPD5Q99666 1765 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ECEL1O95672 775 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 APOEP02649 317 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SKIP12755 728 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH1B1P30837 517 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RAPH1Q70E73 1250 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 STK17AQ9UEE5 414 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SLIT3O75094 1523 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 MED23Q9ULK4 1368 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PPIP5K2O43314 1243 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP21A2P08686 494 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBED6P86452 979 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ORAI2Q96SN7 254 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RBL2Q08999 1139 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 POLA2Q14181 598 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC138Q96M89 665 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PAGR1Q9BTK6 254 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CSADQ9Y600 493 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF1AQ12756 1690 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 MSH2P43246 934 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 LLGL1Q15334 1064 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 NEK9Q8TD19 979 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 COL18A1P39060 1754 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC37A3O60309 1634 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 AFPP02771 609 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 MT-ND3P03897 115 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 IL1RL1Q01638 556 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SLMAPQ14BN4 828 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC24Q50LG9 513 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 BBS5Q8N3I7 341 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC17Q96LX7 622 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 COX16Q9P0S2 106 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 LMO7Q8WWI1 1683 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ERBB4Q15303 1308 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM232C9JQI7 657 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRN2O75325 713 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE8BO95263 885 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CXCR5P32302 372 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3CAP42336 1068 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1E2Q96A05 226 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PGBD1Q96JS3 809 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC5A4Q9NY91 659 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SCOCQ9UIL1 159 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RASGRF2O14827 1237 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 LPXNO60711 386 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 DMTNQ08495 405 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8FQ08AF8 430 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 NNTQ13423 1086 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RFX6Q8HWS3 928 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 IL17REQ8NFR9 667 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 FGD4Q96M96 766 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms