RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	MAFG	O15525	162 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CHMP2A	O43633	222 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	TBC1D8	O95759	1140 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ICAM3	P32942	547 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	FCGRT	P55899	365 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PDILT	Q8N807	584 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC26A4	O43511	780 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNA2	P16389	499 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CTGF	P29279	349 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	RGS2	P41220	211 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	USP6NL	Q92738	828 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	DHX58	Q96C10	678 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CALML4	Q96GE6	196 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	APBA2	Q99767	749 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	NFASC	O94856	1347 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	EML1	O00423	815 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ATP9A	O75110	1047 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	HOXC6	P09630	235 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PLCG1	P19174	1290 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	STAT6	P42226	847 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PSMC4	P43686	418 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	E2F4	Q16254	413 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CAMK4	Q16566	473 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	KRT76	Q01546	638 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SP3	Q02447	781 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	GRB10	Q13322	594 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	KIF22	Q14807	665 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PLIN2	Q99541	437 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.84	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	CTAGE5	O15320	804 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	MED24	O75448	989 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
FAAP20-208	ENST00000420964	CCNE2	O96020	404 aa		13.83	□□□□□ -0.2

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