RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 IGFLR1Q9H665 355 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 MYH6P13533 1939 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 H3BRB1 525 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 CSPG5O95196 566 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 RB1P06400 928 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 MX1P20591 662 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 BMPR1AP36894 532 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0D9SFI3 127 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 OPLAHO14841 1288 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 ST18O60284 1047 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 PTPN5P54829 565 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 DGKHQ86XP1 1220 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 PNMA1Q8ND90 353 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 CD207Q9UJ71 328 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM221A6NGB7 291 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 M0R296 226 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 HSD17B4P51659 736 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 TCF15Q12870 199 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 CAND2O75155 1236 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 ADAM15Q13444 863 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 IL31RAQ8NI17 732 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 APBB2Q92870 758 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 EVI5LQ96CN4 794 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 SETD4Q9NVD3 440 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 NEDD4P46934 1319 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 LGALS2P05162 132 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 CAMK1Q14012 370 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 PGM5Q15124 567 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 ESR2Q92731 530 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 ZMYM6O95789 1325 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 GHRHRQ02643 423 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 FAM26DQ5JW98 314 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 KAT14Q9H8E8 782 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 MMP1P03956 469 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 TGFB3P10600 412 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 ZXDAP98168 799 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 EYA4O95677 639 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFV1P49821 464 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 PRRX2Q99811 253 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 AMNQ9BXJ7 453 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC1BQ9P126 229 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 ENPP3O14638 875 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 CHRNA1P02708 482 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJB1P25685 340 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 ADAM17P78536 824 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 PKN1Q16512 942 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 FBXL6Q8N531 539 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 GFRA3O60609 400 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 KDM4AO75164 1064 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD12-201ENST00000404162 GHRP10912 638 aa22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms