RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 C16orf59Q7L2K0 433 aa35.15■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 GPR20Q99678 358 aa35.15■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 JADE2Q9NQC1 790 aa35.15■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 ESYT2A0FGR8 921 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 ATP9AO75110 1047 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 SEC24BO95487 1268 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 TRIM22Q8IYM9 498 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 SCLYQ96I15 445 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 C16orf70Q9BSU1 422 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 ZMYND12Q9H0C1 365 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 IL23AQ9NPF7 189 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 TELO2Q9Y4R8 837 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-202ENST00000394106 LGALS2P05162 132 aa35.13■■■■□ 3.21
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CMTM4-202ENST00000394106 TMEM240Q5SV17 173 aa35.13■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 MXRA8Q9BRK3 442 aa35.13■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa35.13■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 ADAMTS3O15072 1205 aa35.12■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF365Q70YC5 407 aa35.12■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 VPS54Q9P1Q0 977 aa35.12■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 SREBF1P36956 1147 aa35.11■■■■□ 3.21
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CMTM4-202ENST00000394106 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 RETREG2Q8NC44 543 aa35.11■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC148Q8NFR7 591 aa35.11■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 CYP2W1Q8TAV3 490 aa35.11■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 H3BRB1 525 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 GNA11P29992 359 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF76P36508 570 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 BFSP2Q13515 415 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 GPR153Q6NV75 609 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 CTAGE1Q96RT6 745 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 MAFGO15525 162 aa35.09■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 ARHGAP4P98171 946 aa35.09■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 TRIM50Q86XT4 487 aa35.09■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 KCNH7Q9NS40 1196 aa35.09■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 TPCN1Q9ULQ1 816 aa35.09■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 SZT2Q5T011 3432 aa35.09■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 AK2P54819 239 aa35.08■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 CEP55Q53EZ4 464 aa35.08■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 Q7L0L9 218 aa35.08■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC155Q8N6L0 562 aa35.08■■■■□ 3.21
CMTM4-202ENST00000394106 PITPNM1O00562 1244 aa35.07■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 MCTP2Q6DN12 878 aa35.07■■■■□ 3.2
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CMTM4-202ENST00000394106 DEFB123Q8N688 67 aa35.07■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 BICD2Q8TD16 824 aa35.07■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 RASGRP4Q8TDF6 673 aa35.07■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 DEXIO95424 95 aa35.06■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 FGBP02675 491 aa35.06■■■■□ 3.2
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CMTM4-202ENST00000394106 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 SCRN1Q12765 414 aa35.06■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 ANKRD1Q15327 319 aa35.06■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 DEFB128Q7Z7B8 93 aa35.06■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 SH3GLB2Q9NR46 395 aa35.06■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 SCN5AQ14524 2016 aa35.06■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 TANC1Q9C0D5 1861 aa35.05■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa35.05■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa35.05■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 NLRP5P59047 1200 aa35.05■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 CAGE1Q8TC20 777 aa35.05■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 IL17RAQ96F46 866 aa35.05■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 IQCF3P0C7M6 154 aa35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 HIC1Q14526 733 aa35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 OTOP2Q7RTS6 562 aa35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 SEPT1Q8WYJ6 367 aa35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 SDF4Q9BRK5 362 aa35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa35.03■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 C17orf102A2RUQ5 167 aa35.03■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 MEIS1O00470 390 aa35.03■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 PFKFB2O60825 505 aa35.03■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 CDKL5O76039 1030 aa35.03■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 HERVK_113Q902F9 699 aa35.03■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 NEK4P51957 841 aa35.02■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 PTK7Q13308 1070 aa35.02■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 AFAP1L1Q8TED9 768 aa35.02■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 SLC9A2Q9UBY0 812 aa35.02■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 FAM86B1E9PN63 330 aa35.01■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 CYP3A4P08684 503 aa35.01■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 FAM86B2P0C5J1 330 aa35.01■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 RFC2P35250 354 aa35.01■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 RASIP1Q5U651 963 aa35.01■■■■□ 3.2
CMTM4-202ENST00000394106 PLA2G4DQ86XP0 818 aa35.01■■■■□ 3.2
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