RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CSRNP2Q9H175 543 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 CSF2RBP32927 897 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 AGBL4Q5VU57 503 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 VHLLQ6RSH7 139 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 AJUBAQ96IF1 538 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 MCM7P33993 719 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 FUKQ8N0W3 1084 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 DTX3Q8N9I9 347 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 APBA2Q99767 749 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 MYOTQ9UBF9 498 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 H7BY64 318 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 KNG1P01042 644 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 COMTP21964 271 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 PPP2R5EQ16537 467 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZSN1 163 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 TBX1O43435 398 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 MYO1BO43795 1136 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 LCP1P13796 627 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 KCNAB2Q13303 367 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 TESK1Q15569 626 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC27Q2M243 656 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 DLL4Q9NR61 685 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 C1SP09871 688 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 CASP7P55210 303 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 PAK2Q13177 524 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 SHDQ96IW2 340 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 A0A087X1B8 175 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 CHGBP05060 677 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 INHBCP55103 352 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 LSAMPQ13449 338 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 SCG5P05408 212 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 ECI1P42126 302 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 VASNQ6EMK4 673 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 BACH2Q9BYV9 841 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 KATNBL1Q9H079 304 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 CDIP1Q9H305 208 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 CLDND1Q9NY35 253 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 DGKIO75912 1065 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 IL17DQ8TAD2 202 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 KCND1Q9NSA2 647 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 RAD17O75943 681 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 HOXC12P31275 282 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 CKMP06732 381 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 NAT2P11245 290 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 LTBRP36941 435 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 GRIN1Q05586 938 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 PCSK4Q6UW60 755 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-202ENST00000367364 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.17□□□□□ -1.26
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