RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 FIGNQ5HY92 759 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 EMC4Q5J8M3 183 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 RALGPS1Q5JS13 557 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPR158Q5T848 1215 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 MROH9Q5TGP6 573 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 BROXQ5VW32 411 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CEP128Q6ZU80 1094 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 PASD1Q8IV76 773 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 LZTR1Q8N653 840 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKS4BQ8N8V4 417 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 DLG3Q92796 817 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SCYL1Q96KG9 808 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CAMKK2Q96RR4 588 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC6A20Q9NP91 592 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC52A1Q9NWF4 448 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZIM2Q9NZV7 527 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLAMF8Q9P0V8 285 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 IMPACTQ9P2X3 320 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM59LQ9UK28 342 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SRPK3Q9UPE1 567 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNK3O14649 394 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 MSTNO14793 375 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRC1O43663 620 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 NRDCO43847 1150 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 EFEMP2O95967 443 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 MSL3P1P0C860 447 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CD8BP10966 210 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 GRIK1P39086 918 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC6A11P48066 632 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 EPHA5P54756 1037 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHRNEQ04844 493 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEC23AQ15436 765 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CYP4F22Q6NT55 531 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 GALNT18Q6P9A2 607 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPRED2Q7Z698 418 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHPFQ8IZ52 775 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLCD4Q9BRC7 762 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC13A1Q9BZW2 595 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CD244Q9BZW8 370 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SP110Q9HB58 689 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 PDLIM7Q9NR12 457 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 GABBR1Q9UBS5 961 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACSL6Q9UKU0 697 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 DSEQ9UL01 958 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC5A6Q9Y289 635 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 TAF6LQ9Y6J9 622 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 WASHC2AQ641Q2 1341 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM75PA6NK02 468 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRIT1O00522 736 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SCDO00767 359 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIF3BO15066 747 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 HIP1RO75146 1068 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 TADA3O75528 432 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 RFPL1O75677 317 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 MT-CO1P00395 513 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 NTRK1P04629 796 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 GLI4P10075 376 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYBL2P10244 700 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 RBP3P10745 1247 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC9A1P19634 815 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 TACR1P25103 407 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 LSP1P33241 339 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIF11P52732 1056 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 HK2P52789 917 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRT85P78386 507 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRC32Q14392 662 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIR3DS1Q14943 382 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 NR0B2Q15466 257 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF174Q15697 407 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHRNA2Q15822 529 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC14A2Q15849 920 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTPN21Q16825 1174 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 RGL3Q3MIN7 710 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRSS36Q5K4E3 855 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 STEAP3Q658P3 488 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CPZQ66K79 652 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 NXNQ6DKJ4 435 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 NFXL1Q6ZNB6 911 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCTD1Q719H9 257 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms