RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329970.7

GTF3C6-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C6, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6-201ENST00000329970 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 EFCAB14O75071 495 aa15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CAND2O75155 1236 aa15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 RABGGTBP53611 331 aa15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MICU3Q86XE3 530 aa15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 KCNB2Q92953 911 aa15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 GPR20Q99678 358 aa15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.61■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SIP14410 1827 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MAFGO15525 162 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 NBNO60934 754 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 HIC1Q14526 733 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SKAP1Q86WV1 359 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 RASEFQ8IZ41 740 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 EMSYQ7Z589 1322 aa15.6■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 KIF28PB7ZC32 967 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 KCNA2P16389 499 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 FUT2Q10981 343 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ADGRE1Q14246 886 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ADCK5Q3MIX3 580 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 FBXL16Q8N461 479 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 WNT8BQ93098 351 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TTC28Q96AY4 2481 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 NID2Q14112 1375 aa15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 NCOR1O75376 2440 aa15.58■□□□□ 0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 ZBTB43O43298 467 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SORBS3O60504 671 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 GNAT1P11488 350 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 MYOGP15173 224 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 KCNJ6P48051 423 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 ADAM17P78536 824 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 RTN1Q16799 776 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 USP38Q8NB14 1042 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 GLT8D2Q9H1C3 349 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.58■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CA3P07451 260 aa15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 ITGB5P18084 799 aa15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 MBTPS1Q14703 1052 aa15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 JADE2Q9NQC1 790 aa15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 COL4A6Q14031 1691 aa15.57■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 WDR81Q562E7 1941 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 TREHO43280 583 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 LGR5O75473 907 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 RSPH10BP0C881 870 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 HSPA4P34932 840 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 AP3B2Q13367 1082 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 MTMR1Q13613 665 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 IKBKEQ14164 716 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 UBE2SQ16763 222 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 RPAINQ86UA6 219 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 TCEANC2Q96MN5 208 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 BARHL2Q9NY43 387 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 NRCAMQ92823 1304 aa15.56■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.55■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15.55■□□□□ 0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms